保函根据开出的主体不同，目前主要分为三大类，银行保函，诉讼保函，担保公司保函，其中银行保函又分为工程类和采购类。
根据用途不同，又可以分为投标保函，履约保函，预付款保函，农民工工资担保函等。
一、三大保函的特点
银行保函特点：
银行保函费用比担保公司保函高，银行保函认可程度高，没有区域限制，全国范围内通用。但是银行风控对施工资质有一定要求，另外银行保函对保函条款要求严格，不容易更改。施工资质差的项目开银行保函会要求交保证金，比例百分之5到10。银行保函按年收费并要求覆盖工期，不足一年按照一年计算。采购供货类项目保证金比例百分之20到百分之30，银行保函有最低收费标准，视银行审核周期，保函开出周期大约一周。
担保公司保函特点：
费用低，速度快，认可度较银行保函低，认可程度一般有区域限制，担保公司保函有价格低和免交保证金的特点，适用资质一般但是要求开保函的项目，一般按笔收费，资料齐全最快当天出保函。
诉讼保函：
适用于诉讼前、诉讼中的财产保全，费用低，速度快，诉讼保函资料齐全最快当天出保函，不做解除保全类业务。
注意：具体项目中用担保公司保函还是银行保函以及担保比例多少详见招标文件要求，特殊情况下，可以用担保公司保函取代银行保函，以达到节约时间节约费用的目的。
二、几种保函的区分
1、投标保函
投标保函（bid bond,tender guarantee）是指投标人向招标人递交投标书时，必须随附银行的投标保函。开标后，中标的投标人先前附来的银行投标保函立即生效。
2、履约保函
履约保函 performance guarantee，履约保函是指:应劳务方和承包方(申请人)的请求，银行金融机构向工程的业主方(受益人)做出的一种履约保证承诺。如果劳务方和承包方日后未能按时、按质、按量完成其所承建的工程，则银行将向业主方支付一笔约占合约金额5%~10%的款项。履约保函有一定的格式限制，也有一定的条件。
3、预付款保函
预付款保函（advance payment guarantee）,又称还款保函，是指担保人（银行）根据申请人（合同中的预收款人，通常情况下是出口商）的要求向受益人（合同中的预付款人，通常是进口商）开立的，保证一旦申请人未能履约，或者未能全部履约，将在收到受益人提出的索赔后向其返还该预付款的书面保证承诺。
4、支付保函
支付保函即履约保函，可分为工程款支付保函、业主支付保函等等。工程款支付担保是指为保证业主履行工程合同约定的工程款支付义务，由担保人为业主向承包商提供的，保证业主支付工程款的担保。