申请民用无人机驾驶航空运营合格证变更的时间和流程如下：
时间
民用航空管理部门收到申请后，应当进行运营安全评估，根据评估结果依法作出许可或者不予许可的决定。通常情况下，如果申请材料齐全、符合要求，且运营安全评估顺利，可能在数周内完成审核并颁发新的合格证。但如果存在问题需要进一步核实或补充材料，所需时间会相应延长。
流程
准备材料：准备好需要变更的相关证明材料，如营业执照变更证明、法定代表人变更证明等，以及原民用无人驾驶航空器运营合格证。
在线申请：登录 “民用无人驾驶航空器综合管理平台（UOM）”。使用企业已注册账号登录，进入运营许可模块，找到合格证变更申请入口，一般在相关菜单中有 “合格证变更” 或 “信息修改” 等选项。按照系统提示填写变更信息，如企业名称、经营范围、法定代表人等信息发生变更，需准确填写新的信息，并上传相关证明材料。
提交申请：确认填写的信息和上传的材料准确无误后，点击 “提交” 按钮，将变更申请提交给民用航空管理部门。
审核与评估：民用航空管理部门收到申请后，会对申请材料进行初审，检查材料是否齐全、合规。可能会根据具体情况进行运营安全评估，包括对企业的运行管理、人员资质、设备状况等方面进行审查，以确定变更后的运营是否仍符合安全要求。如有需要，管理部门可能会要求企业补充额外的材料或进行现场检查。
领取新证：如果变更申请审核通过，民用航空管理部门会颁发新的民用无人驾驶航空器运营合格证。企业可以通过平台下载电子版合格证，或者按照管理部门的通知要求，前往指定地点领取纸质版合格证。
