工商电子签名网上认证的流程通常如下：
注册账号访问当地工商（市场监督管理）网上登记服务平台，点击 “立即注册”。账号注册实行实名制，一个身份证件只能注册和拥有一个账号。
登录与选择签名方式自然人电子签名
身份核验：登录系统后，根据身份证类型选择签名方式。以网页电子签名为例，需准确录入身份证件和实名手机号（或）信息。
人脸识别：使用手机微信或支付宝扫描屏幕上弹出的二维码，完成人脸识别。
经营主体电子签名
选择 “我是企业”：开始电子签名，法定代表人使用微信 “电子营业执照” 小程序的 “扫一扫” 功能，扫码页面二维码，认证经营主体身份并登录系统。
输入密码：在小程序中输入电子营业执照密码。
身份核验或登录通过后，系统将展示所有需要签署的电子文件，可以按需选择多份文件，一次完成签署，但一次批量签名只能签署同一申请中的文件。
完成签名自然人电子签名：完成批量签署后，根据系统提示，再次使用手机微信或支付宝扫描屏幕上弹出的二维码，完成人脸识别，即完成电子签名。
经营主体电子签名：点击 “批量签署”，根据系统提示再次使用微信 “电子营业执照” 小程序 “扫一扫” 功能，扫码屏幕上弹出的二维码，录入电子营业执照密码验证经营主体身份，在小程序中输入电子营业执照密码并确认签名，即可完成电子签名。
不同地区的工商电子签名网上认证流程可能会有所差异，例如山东省还提供手机设备签名（全程电子化手机 APP）和银行设备签名（中国银行、中国农业银行、中国工商银行、中国建设银行的网银 U 盾或中国工商银行 eID 卡）等方式。在进行电子签名前，建议先仔细阅读当地工商部门提供的相关指南和说明，确保操作准确无误。
