冬虫夏草发酵生产的目标是获取冬虫夏草有效部分――菌丝体，而不是全株冬虫夏草。两者是同一种菌的两种不同生长形态。两者相同之处：
（一）、菌种相同，“蝙蝠蛾被毛孢”菌分离于青海产冬虫夏草。在生物界，检验菌种真伪公认的方法是“生物还原法”：将分离的菌种在产地接种蝙蝠蛾幼虫体或在实验室人工离体培养，使之生长出含子囊孢子的子座，是准确无误检测该菌种是否是冬虫夏草无性阶段的最好方法。“蝙蝠蛾被毛孢”既可以在蝙蝠蛾幼虫体上接种成功，长出全株冬虫夏草；同样也可以在人工灭菌培养基上完成从菌丝菌落、子座、子囊果、子囊孢子完整的发育周期，长出与冬虫夏草一模一样的子座，充分证实了此菌是真正的冬虫夏草菌。
（二）、生长温度相同，冬虫夏草适宜生长温度为高原雪线以上。“蝙蝠蛾被毛孢”适宜生长温度也为高原雪线以上，因此“蝙蝠蛾被毛孢”菌丝的发酵生产必须使用“冷发酵技术”，否则生产不出“蝙蝠蛾被毛孢”菌丝。
（三）、成份极为相近，以“蝙蝠蛾被毛孢”为菌种在高原雪线以上温度四级发酵生产冬虫夏草菌丝，保证了菌丝的成分及含量。以冬虫夏草为对照，经中国中医研究院中药研究所、北京市理化分析测试中心检测其成份及含量、功效与冬虫夏草非常接近，是冬虫夏草最佳的替代品。
“蝙蝠蛾被毛孢”菌丝是可以替代冬虫夏草的唯一人工产品。它的问世，是我国珍稀中药材人工制取替代研究开发、生产的重大突破，科技含量高，用途广泛。不仅可以做为保健食品的原料，也可以用于生物、植物药的研究和开发，为冬虫夏草的开发利用提供了充足质优价廉的原料，进一步满足了市场需求，减少冬虫夏草采取量。同时，保护了珍稀的冬虫夏草资源和产区生态，实现了开发与环保的和谐统一。