碘酸氢钾的储存必须严格遵循氧化剂的储存规范，核心是防止其发生意外氧化还原反应。
密封与防潮： 储存于密封良好的容器中，放置于阴凉、干燥、通风良好的仓库内。防止其吸潮结块，也防止粉尘逸散。
与不相容物严格隔离（重中之重）： 这是储存最关键的一点。必须与以下物质分库或隔离储存，严禁混放：
易燃物和可燃物： 如木材、纸张、纺织品、溶剂等。
还原剂： 如硫化物、磷化物、金属粉末（、、镁粉等）、碳粉、有机物（糖、淀粉等）。
强酸： 如、、硝酸等。
铵盐： 因为氧化剂与铵盐混合可能形成爆炸性混合物。
防火防震： 储存区必须远离热源和火种。搬运时应轻拿轻放，防止摩擦和撞击，以免引发分解或剧烈反应。
容器材质： 使用不易产生火花的材质制成的容器，如塑料桶或内衬塑料袋的编织袋。
消防措施： 储存区域应配备相应的消防器材，如大量水、砂土。但需注意，扑救由其引发的火灾时，应避免使用高压水流直接冲击，以免粉尘飞扬引起二次爆炸，宜用雾状水或砂土覆盖。