受结构制约，柴油发电机组无法做到完全防水，当雨季/台风季来临时，柴油发电机组便有可能遭受洪水、暴雨等自然灾害的影响，当柴油发电机组内部进水时，用户要及时采取必要的措施，断开外电源及蓄电池接驳线，不可运转发动机，也不可尝试盘转曲轴，禁止运转发动机，同时检查各个部位的进水情况。
1、检查排气管路（排烟管最低处或消声器）的排水构件是否有水排出。
2、检查空气滤清器外壳是否有积水，滤芯是否被水浸渍。
3、检查发电机外壳底部是否有积水。
4、检查散热器、风扇、联轴器等回转部件是否堵塞。
5、外部是否有机油、燃油或水的渗漏。
6、拆下摇臂室盖，观察是否有进水。检查发电机绕组绝缘/污染情况。
7、检测控制线路和输出电路的绝缘。检测控制面板模块、各仪表、告警装置、启动开关。
注意：绝对不能让水侵入发动机的燃烧室！
柴油发电机组进水后的处理办法：
当判断柴油发电机组发动机的燃烧室没有进水，绝缘符合要求时，可启动柴油发电机组。在启动时要注意以下问题：
1、在启动前进行所有检查，包括排放燃油箱积水。电气系统逐步上电，观察是否有异常。
2、连续启动发动机的时间不得超过30秒钟。若发动机不能着火，则检查燃油管路及电气回路，一两分钟后再次启动。
3、检查发动机声音是否有异常，是否有异味。检查电气仪表的显示、液晶显示屏是否断屏或者显示不清。
4、密切观察机油压力和水温度，如果油压或温度不符合技术规范，应关闭发动机。停机后，检查一次机油平面。
当判断发动机可能进水、发电机绝缘不符合要求时，切勿擅自维修，应寻求发电机组厂家的专业技术人员的帮助。