实验室超纯水机的使用过程中，运行成本的控制是至关重要的一个方面。由于耗材更换、维修保养比较昂贵，所以如何降低超纯水机的运行成本就是一个非常重要的问题。
首先，要降低耗材的更换频率。很多超纯水机纯化柱更换非常频繁，没用多久就已经到期了，原因通常是纯化柱交换量过小，或者是三级水水质太差，对纯化树脂消耗过大。那么想要解决这些问题，就需要增大交换量，即增加了处理水量；还要保证三级水达标，即减少对纯化柱的消耗，也间接增大了处理水量。
艾科浦超纯水机的专利深度除盐技术，保证了反渗透模块稳定高效地产出达标的三级水，这样就很大程度上减少了对纯化树脂的消耗；同时，艾科浦装置超大量的纯化树脂，可以保证水处理量在20吨以上。
其次，水机的维修保养方面要简易。对于内部结构复杂的水机来说，每进行一次维修保养都需要工程师来操作，用户就需要支付额外的费用，而且等待工程师的工程还会耽误工作时间。
艾科浦超纯水机独有的模组化设计，让零部件更换拆装非常方便，用户可以很轻松地自行操作。
最后，多用户使用时的成本分摊。对于多个实验室公用水机的情况，如果可以进行成本的分担，也是一种节约成本的好方法。艾科浦超纯水机的智能系统，能够分账户独立记录数据，每个实验室一个账户，在使用时的所有运行数据、水质数据都被自动的记录，而且还可以随时查阅。
有了以上的这些功能，就可以达到降低超纯水机使用成本的目的了。这些方面的进步，也正是超纯水机未来发展的大方向。