1、个体工商户开发票时只能代开，而注册公司可以直接进行开票，公司在缴纳开票税务的时候都是根据实际开票收入来进行缴纳，如果没有进行开票则可以不用交税，个体工商户要求按月完成缴纳税务。
2、公司主要以法人为主体的注册形式，其注册范围比较广，个体工商户都是基于个人为主体，规模发展存上面在明显局限性。
3、个体工商户不能升级资质，公司注册可以，个体户的经营模式无法承担与其他合伙人做生意的模式。
4、个体工商户不接受进出口业务，对于税务也不接受国外税务。
5、就税率而言，个体不能申请17%，只有申请小规模纳税人(3%)。