桶装纯净水由于加氯消毒可产生一些新的有机卤代物，主要成分是（氯仿）和及少量的一氯甲烷、一溴二氯甲烷、二溴一氯甲烷以及溴仿等，统称为卤代烷。经检测，经过加氯消毒的饮用水、自来水中卤代烷含量一般高于水源水。
其中以和含量较高，对人体存在一定危害，如果长期饮用氯仿和超标的纯净水，严重时会导致肝中毒甚至癌变
污染防治
1、加强自身卫生管理，强化食品卫生质量意识，一名领导负责卫生工作，设立专职卫生检验机构，加强对水源、包装物、灌装间空气和产品检测，制订从水源管理、杀菌、灌装、
包装到个人卫生各环节的卫生管理制度，并专人监督实施，加强食品卫生知识的培训学习，重点掌握消毒方法和明确微生物容易污染关键环节。
2、根据水源的特点，合理、科学地设计生产流程，配备必要的水处理和生产设备，选择符合水消毒的灭菌系统。我国矿泉水和纯净水多使用紫外线、超滤和臭氧作为除菌和消毒杀菌设施。但多年的经验证明前两种可靠性差，是造成产品不合格的主要因素，而采用臭氧杀菌被认为是目前的方法。
3、定期加强对生产全程的管道，容器和过滤器等有关设施的清理和消毒，做好瓶、盖和灌装间的消毒工作。据了解多数厂家的管道和包装物的消毒采用二氧化氯（ClO2），该药物具有很强的氧化和消毒作用，但要加强对消毒药物的质量监控，保证其消毒效果。