不管是屋面变形缝使用何种防水材料和防水结构，都需要进行多道设防，并且保证变形缝宽度变化时，防水结构也不会被破坏。
伸缩缝的防水做法一般是在防水墙的底部涂抹防水层和缝隙衔接材料，然后表面再加涂一布和两层加强层。
沉降缝多为高低变形结构，通常防水处理是在屋面设置卷材为防水层，将卷材钉压在高层墙体上，让其向缝隙中下凹，一边固定在高层墙顶，一边黏贴在屋面防水层上，卷材表面再使用金属板做单边固定保护。然后，施工人员进行防水层涂膜处理，将合成高分子卷材与防水层涂膜进行粘结。
防震缝的防水层应该高出屋面矮墙或天沟侧壁顶面，将其上部使用合成高分子卷材进行覆盖，在卷材中间下凹到变形缝内2厘米左右，将凹槽内铺垫聚乙泡沫条，连接墙体两边与屋面防水层，之后，再加铺一层合成高分子卷材，卷材两边覆盖住上一层卷材的连接缝，*后，再用细石混凝土或不锈钢盖板压盖，这样整体防水处理就完成了。
屋面变形缝图集和做法要点有很多，从国标图集04cj01-1、04cj01-2、04cj01-3到各地方图集中都有详细描述了屋面变形缝构造节点，虽然名字ＲＭ,ＳＲＭ,Ｒ-ＷＭ,ＳＲ-ＷＭ、QCC、QCC-1、LCC、LCC-1、WDP、WDJ、WDP-II、WDJ-II不同，但是原理还是相似的，按构造可以分为三类：金属盖板型屋面变形缝、抗震型屋面变形缝和V字型平屋面(上人屋面)变形缝，其中前两者的伸缩原理是一样利用滑竿自由移动来确保屋面变形缝装置的伸缩量，而V字型平（坡）屋面变形缝是利用盖板中心的凸起部位进行拉伸和压缩