深圳办理GMP认证的流程主要包括以下几个步骤：
准备阶段：企业确定申请GMP认证的范围和需要认证的产品种类，了解相关法律法规、标准和要求，并做好相关准备工作。
预审阶段：企业将自己的资料提交给当地GMP认证机构，由专业人员进行初步审查，确认是否符合GMP认证要求，并告知企业如何进行下一步的申请。
现场审核阶段：认证机构会派遣专家到企业现场进行审核，对生产设施、质量管理体系、文件管理等方面进行全面检查。
审核报告及整改阶段：审核结束后，认证机构会根据审核结果，向企业发放审核报告并提出相关的问题和建议。企业需要制定整改计划并在规定时间内完成整改，以达到GMP认证标准要求。
再次审核阶段：经过整改后，认证机构会重新派遣专家进行审核，确认企业已经满足GMP认证标准要求，并向企业颁发GMP认证证书。
维持阶段：GMP认证是一个动态的过程，企业需要不断维护和改进质量管理体系，定期接受认证机构的监督和检查，并进行再次审核，以维持GMP认证证书的有效性。
需要注意的是，GMP认证的具体流程可能因地区、行业等不同而有所差别，在办理前应仔细了解当地的要求和规定。同时，企业应该注重建立**的质量管理体系，确保所有产品都能符合国家规定的标准和要求。