1、加工贸易备料保税仓库。这是一类为来料加工、进料加工等加工贸易储存进口原材料等物资提供服务的保税仓库。由常年从事加工贸易出口鼓励产品的加工生产企业申请设立。 经营单位为了加工产品出口的需要，不断地从国际市场上购进所需原材料、零部件等物资，储存在保税仓库以备随时加工成品出口。加工贸易备料保税仓库是我国保税仓库中的主要类型。
2、寄售、维修、免税商品保税仓库。这类保税仓库是为外国产品在我国寄售及维修进口机器设备所需要零部件和进口外汇免税商品服务的，外国商品进境是存放在保税仓库，待销售、维修或供应时，海关按规定予以征税或减免。