超声波粉碎机使用的好与不好，会直接体现在它的寿命上，所以在日常的使用过程中，操作者必须注意一些事项，以防止造成仪器出现故障，影响正常使用。除了要注意使用，维护保养也非常重要。
超声波粉碎机使用说明书：
1、把与变幅杆相连的换能器放入隔音箱顶部的专用插孔内，完后把电源线连接在主机后面的电源输入接口；并连接好主机电源线。
2、设定“超声时间、间隙时间、工作次数”，一般超声时间不宜开的过长，控制在1-5秒为宜，工作时选用间隙时间大于工作时间进行实验。
3、根据样品量选用适配容器（试管、烧杯及离心管），固定好后，调节隔音箱内的升降台来确定高低位置，使变幅杆末端插入样品液面1-1.5cm并使其在容器的中心位置，不得让变幅杆与容器壁相接触；变幅杆末端离容器一般应大于30mm，量小时，功率开小的情况下可大于10mm(视容器而定)。
4、开机后电源指示灯亮，再按一次保护复位按钮及工作复位按钮。
超声波细胞粉碎机使用注意事项：
1、严禁在超声波粉碎机的变幅杆未插入液体内(空载)时开机，否则会损坏换能器或超声发生器。
2、对各种细胞破碎量的多少，时间长短，功率大小，有待用户根据各种不同细胞再摸索确定，选取准确值。
3、超声波粉碎机采用无工频变压器开关电源，在打开发生器机壳后切勿乱摸，以防触电。本仪器性能可靠，一般不易损坏。
4、在超声破碎时，由于超声波在液体中起空化效应，使液体温度会很快升高，建议采用短时间(每次不超过5秒)的多次破碎，同时可外加冰浴冷却或选配本公司的低温循环泵。
5、功率表显示的数值与电压、变幅杆插入液面深度及负载与被破碎样品的浓度、稠度有关，变幅杆插入液面较深，负载浓度较大，显示数值可能要稍小，反之稍高。
6、短时间的多次工作比连续长时间工作的效果要好，为防止液体发热，可设定较长的间隙时间，不间断长时间工作容易形成空载，缩短超声波粉碎机的使用寿命。