动物实验室除了需控制粉尘浓度外还要控制病菌个数,故不能采用带回风的空调系统,而只能采用直流式空调系统(洁净走廊可采用一次回风);为保证需要的洁净度,所需新风量远大于处理室内负荷所需的风量。新风量越大,处理新风需要的能量越多,同时也导致排风量增大,排风带走的热量增加，因此如何回收排风中的能量,对降低动物实验室洁净空调系统的能耗具有重要意义。
实验动物容易受到环境干扰，且在饲养过程中会产生异味，影响其他生产或生活用房，因此实验动物房总体布局的选址和建造基本要点有：独立建造动物房；避开车流和人流密集处，避开厂区震动和噪声大的区域；选择在全年主导风向下风处，且对厂区其他生产或生活设施影响小的区域。
动物实验室的建筑墙板和顶棚的材料，可采用洁净夹心彩钢板，圆弧角采用铝合金材质制成。地面采用PVC材质，耐酸碱，受损后易于修补。为了保障实验动物房的洁净环境，动物实验室的空调系统采用初、中、高效三级过滤模式。换气次数根据实验室面积、高度和内部发热情况，通过空调的送风和排风实现。
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