百级洁净车间内尘埃粒子超标时，应综合考虑多个因素并采取综合措施来处理。以下是一些建议：
检查并改善通风系统：确保通风设备正常运行，并合理设置通风设备，以保证室内空气流通性，尽可能减少室内尘埃积聚。定期检查和维护通风设备，确保其正常运转。
规范操作和设备存放：员工应对设备进行合理堆放，减少杂物，降低不必要的灰尘产生。规范清洁作业操作流程，及时更换及清洗清洁器材，确保器材的清洁，减少尘埃的产生。
加强地面清洁：保持室内整洁，及时清理地面积尘物，减少灰尘的积累。对一些密封性不好的地方进行密封，同时对洁净室进行彻底清洁，包括一些角落都要打扫干净。
检查高效过滤器：检查高效过滤器是否存在堵塞或泄露等问题，如有问题应及时处理。如过滤器损坏严重，可能需要更换新的过滤器。
提高员工意识：车间员工需要接受有关尘埃粒子控制和预防的培训，了解如何正确使用防护设备和遵守相关规定。
建立质量监控体系：百级车间应建立完善的质量监控系统，包括定期抽样和分析空气样本，使用颗粒计数仪等，以监测和评估尘埃粒子的浓度。
管理体系优化：建立有效的尘埃粒子控制管理体系，制定相关的标准操作规程，监控和纠正措施，并进行定期的内部审核和外部审核。
综上所述，处理百级洁净车间内尘埃粒子超标问题需要从多个方面入手，通过改善通风、规范操作、加强清洁、检查过滤器、提高员工意识、建立质量监控体系以及优化管理体系等措施，共同营造一个洁净、稳定的工作环境。