京东自营店的申请入驻流程主要包括以下几个步骤：
注册京东账号：首先，你需要在京东网站上注册一个账号。如果你已经有京东账号，可以直接登录。
提交入驻申请：登录后，前往京东自营入驻页面，点击“入驻申请”按钮。你需要填写入驻申请表，包括基本信息、店铺信息、商品信息等，并上传相关证照和材料，如营业执照、税务登记证等。
资质审核：京东会对你提交的材料进行严格的资质审核，包括企业资质、品牌授权、商品质量等方面的评估。审核通过后，京东会与你进一步沟通后续事宜。
签订入驻协议：审核通过后，你需要与京东签订入驻协议。协议内容包括商品上架、订单处理、售后服务等条款，确保双方权益得到保障。
店铺准备与培训：在入驻前，你需要完成店铺的装修和设置，确保店铺页面美观、易于导航。同时，京东会为你提供店铺培训，帮助你了解如何操作店铺、发布商品等。
商品上架与审核：你需要按照京东的要求上传商品信息、设置价格、库存等，并提交给京东进行审核。审核通过后，商品即可上架销售。
正式运营：商品上架后，你就可以开始正式运营你的京东自营店了。你需要及时处理订单、发货、售后等各项业务，确保消费者的购物体验和满意度。