二级分销商城系统原生APP的开发功能主要包括以下几个方面：
多级分销模式：支持多级分销模式，商家可以自定义分销员等级、佣金比例等参数，以适应不同的业务需求。分销员可以通过分享商品链接吸引更多消费者购买，并从中获得佣金收益。
商品管理功能：小程序支持商品的上架、下架、分类管理等功能，方便商家对商品进行统一管理。同时，可以根据市场需求调整商品价格、库存等信息，以保持销售的竞争力。
订单处理系统：消费者在小程序上购买商品后，订单信息会自动进入订单处理系统。商家可以实时查看订单状态、发货情况等信息，以便及时处理订单和跟进售后服务。
佣金结算功能：商家可以设置佣金结算规则和周期，系统会自动计算分销员的佣金并进行结算，确保利润分配的公正性和及时性。
分销管理功能：包括分销商注册、订单处理、佣金计算、提现处理等，简化操作流程，确保分销商能够轻松地追踪自己的销售业绩和收入。
数据安全与隐私保护：二级分销系统APP必须遵守相关的数据保护法规，并采取加密、认证等技术手段来保障用户信息的安全。
营销工具集成：为了提高用户的参与度和转化率，APP可以集成各种营销工具，如优惠券、积分奖励、限时折扣等。这些工具不仅能够吸引新用户，还能鼓励现有用户进行更多的分享和销售。
多平台兼容性：为了覆盖更广泛的用户群体，二级分销系统APP应该支持不同的操作系统和设备，包括iOS、Android等。
用户管理与互动：提供用户注册、登录、个人信息管理等功能，同时支持用户之间的互动，如评论、分享等，以增强用户粘性和促进销售。