巴基斯坦出口集装箱到蛇口港的清关过程涉及多个环节，以下是根据参考文章和当前情况整理的相关信息：
一、清关前准备
文件准备：
提单原件2份，需背书签字盖章（Bill of Loading）。
商业发票原件3份（Commercial Invoice）。
装箱单原件3份（Packing List）。
相关合同（Contract），复印件即可。
如果有FTA（Free Trading Agreement），需要提供原件。
每种货物的图片以及详细的装箱清单（分箱单）。
注意事项：
所有单据信息必须保持一致，包括重量、体积以及货物外包装上的信息。
必须提供正确的信息，不能瞒报、谎报货物信息，否则后果自负。
根据货物类型，可能还需提供其他文件或第三方检测证明。
所有单据需为英文版或中英文版。
二、到港后操作
填写货物申报单：根据客户提供的资料，填写货物申报单。
海关检查：所有进口物品必须接受海关的检查，以确保它们符合巴基斯坦的质量和安全标准。如果物品没有通过检查，就不能被进口到巴基斯坦。
三、时间预估
根据参考文章4的信息，清关时间大概是4-6个工作日，发货需要3-5个工作日。但请注意，实际时间可能会因各种因素而有所不同。
总结：巴基斯坦出口集装箱到蛇口港的清关过程需要准备充分的文件资料，按照流程办理，并接受海关的检查。同时，需要考虑相关的费用和时间安排。为了确保清关过程的顺利进行，建议货主与清关代理公司保持密切沟通，并及时了解新的清关政策和要求。