包装机海运出到南非的拼箱操作可以按照以下步骤进行：
前期准备：
市场调研：首先，对南非市场进行调研，了解需求和竞争情况，以便制定合适的出口策略。
选择可靠的货运代理：选择一家经验丰富、信誉良好的货运代理公司，他们将提供从订舱、装箱、报关到运输和清关等一系列服务。
准备出口文件：根据南非海关的要求，准备商业发票、装箱单、提单、产地证明等出口文件，并确保这些文件准确无误。
货物拼箱：
选择合适的拼箱方式：根据包装机的性质、数量和体积，选择合适的拼箱方式，如整柜拼箱或散货拼箱。
装箱注意事项：在装箱过程中，确保包装机包装完好、标识清晰。对于易碎或易损的部件，应采取相应的保护措施。同时，注意货物的摆放顺序和稳定性，避免在运输过程中发生损坏或移位。
操作流程：
询价报价：向货运代理咨询海运拼箱的价格和服务细节。
订舱：货运代理根据发货人的要求，在规定时间内（通常是在船到港前5天）向船公司或其代理人申请订舱，并提交订舱单（包含收货人、通知人、商品名称、件数、包装、毛重、尺码等信息）。
给客户送货通知：货运代理通知发货人将货物送至指定的CFS（拼箱集装箱货运站）仓库。
货物入仓与确认：发货人将包装机送至CFS仓库，仓库进行货物的确认和重尺测量。
装箱：CFS集装箱货运堆场根据货物情况安排装箱。
报关：货物进出口报关，确保报关文件与舱单数据一致。
等待出发：货物放行后等待出发。
费用确认与付款：出发后，货运代理与发货人确认费用并签署提单。
到达南非：
集装箱货物卸下进入码头堆场，统一转移到CFS集装箱货运站取货。
货运代理在南非的代理负责向口岸海关进行分拨货申报，然后将集装箱提出后到海关监管所分拨。
船代签发提货单，确认船公司提单的舱单信息给海关。
代理负责签发分拨提货单，确认分单的舱单信息。
收货人按照海运规定换取分拨货提货单。
报关行向海关和检验检疫机构办理通关手续，在分拨货提货单上加盖海关和检验检疫机构的放行章。
注意事项：
特别注意相关运输条款，包括运输方式和付款方式，确保与信用证的要求一致。
注意拼箱货物的收费标准，通常是根据货物的体积和重量计算。
对于偏远的航线和港口，需要在签订合同前咨询，确认船舶公司和货运代理公司能否承担内陆点的发货及相关费用。
以上是一个大致的操作流程和注意事项，具体细节可能会因实际情况而有所不同。建议在实际操作中与货运代理保持密切沟通，确保货物顺利出口。