印尼雅加达整柜货物报关运输是一个涉及多个环节和复杂程序的过程，以下是根据现有信息整理的一个大致流程和相关注意事项：
一、前期准备
确定货物信息：
详细了解货物的种类、数量、尺寸、重量等基本信息，以便后续制作货物清单和文件。
选择物流服务商：
选择有丰富经验和良好信誉的物流服务商，如货运代理或物流公司，他们能提供的整柜运输服务，并协助处理报关手续。
准备必要文件：
根据印尼海关的要求，准备进口许可证（如适用）、商业发票、装箱单、提单等必要文件。对于特殊货物，如危险品，还需准备MSDS（材料安全数据表）和非危保函等文件。
二、订舱与装箱
订舱：
向物流服务商或船公司提交订舱申请，明确货物的起运港、目的港、箱型、柜量等信息。
装箱：
按照承运商的要求进行装箱，确保货物在集装箱内妥善固定，避免在运输过程中发生损坏或泄漏。对于危险品等特殊货物，需遵循特殊的包装和装箱要求。
三、报关与清关
提交报关资料：
将准备好的报关资料提交给物流服务商或报关行，由其代为办理报关手续。报关资料需准确无误，以避免因资料错误导致报关延误或退单。
缴纳税费：
根据印尼海关的规定，缴纳相应的关税和其他税费。税费的金额取决于货物的种类、数量和价值等因素。
配合查验：
如遇海关查验，需配合海关人员进行查验，并提供必要的协助和说明。确保货物与报关资料一致，无违禁品或敏感物品。
四、运输与交付
海运运输：
货物装船后，开始海运运输。从中国到印尼雅加达的海运时间通常约为12-15天，具体时间取决于航线、船期和天气等因素。
目的港操作：
货物到达雅加达港口后，进行卸货、堆存等操作。物流服务商或承运商会负责将货物从港口运至指定仓库或收货人地址。
清关完成：
清关手续完成后，收货人可凭相关单据提取货物。物流服务商通常会提供送货上门服务，但具体派送时间会因物流公司和地理位置而异。
五、注意事项
了解法规：
在出口前需了解印尼的进口法规、关税政策、进口限制等相关信息，以确保货物能够顺利进口。
选择可靠服务商：
选择具有丰富经验和良好口碑的物流服务商或报关行，以确保运输和报关过程的顺利进行。
确保文件准确：
报关资料需准确无误，避免因资料错误导致报关延误或退单。同时，需确保所有文件均符合印尼海关的要求。
关注运输动态：
密切关注货物的运输动态和预计到达时间，以便及时做好接收准备。
遵守国际贸易规则：
遵守国际贸易规则和惯例，如FOB、CIF等贸易条款，以确保双方的权益得到保障。
以上信息仅供参考。具体流程和注意事项可能会因实际情况和新政策而有所变化。建议在实际操作前咨询的物流服务商或报关行以获取新和准确的信息。