上海二类医疗器械备案网上申报流程如下：
1. 登录上海市市场监督管理局（网址：https://sh.smj.gov.cn/），点击“互联网+政务服务”平台。
2. 选择“在线办理”，填写企业名称、社会信用代码和验证码，点击“登录”。
3. 进入办理页面，选择“第二类医疗器械经营备案（变更）”业务。
4. 填写申请信息，上传备案所需的相关材料。
5. 预览无误后，点击“提交”，完成备案申请。
6. 等待审核结果，如需现场核验，按要求前往相应地点。
上海二类医疗器械备案必要完整资料包括：
1. 第二类医疗器械经营备案表和告知承诺书。
2. 营业执照和组织机构代码证复印件。
3. 法定代表人、企业负责人、质量负责人的身份证明、学历或者职称证明复印件。
4. 经营范围、经营方式复印件。
5. 经营设施、设备及保证人体健康、人身安全的经营环境的相关资料。
6. 地址位置的房产证及租赁合同等。
希望以上信息对你有帮助，如果需要更多信息，建议到当地市场监督管理局官网查询。