FDI 外汇登记的负责部门主要有外资委、商务部、发改委和外管局。企业办理 FDI 外汇登记时，首先国外投资者在进行外商直接投资前，应明确外商企业和投资的项目是否符合外商投资准入负面清单的要求，准备外商投资项目的方案，告知企业情况、项目如何实施、项目效益、资金真实性等等，根据投资的金额和投资项目所在的行业，匹配到相关部门去申请。FDI 投资备案的流程通常如下：在发改委申请投资项目立项，该项目通过核准之后才能正式进行备案程序；提交项目相关资料和企业信息给到商务部进行核准，通过审核后会获得 FDI 备案证书；拿着证书到外管局做一次备案，通过外管局的备案后才可以进行 FDI 外汇登记。按照 FDI 外汇登记的流程完成资金的进出：外汇登记 - 开立账户 - 资金汇入 - 资金到账登记 - 结汇使用 - 盈利汇出 - 注销账户。例如，企业在进行外汇登记时，要准确填写相关申请表格，提供商务部门的批准文件、公司章程、股东信息等材料。在开立账户阶段，根据投资币种在银行开立相应资本项目账户。资金汇入后，银行会进行到账登记，确保资金的安全和可追溯性。结汇使用时，要根据不同的结汇方式提供相应材料，如意愿结汇需提供《支付命令函》、资金入账登记凭证等；支付结汇需提供《资本项目账户资金支付命令函》、货币出资入账登记表等。盈利汇出时，要在符合相关规定的情况下进行操作。
企业办理 FDI 后，应向税务机关申请税务登记，获取税务登记证。外商投资企业提交年度报告，应当报送企业基本信息、投资者及其实际控制人信息、企业经营和资产负债等信息，涉及外商投资准入特别管理措施的，还应当报送获得相关行业许可信息。在税务登记过程中，企业要准确提供相关信息，确保税务申报的准确性和及时性。例如，企业要明确自身的纳税义务，包括增值税、企业所得税等税种的申报和缴纳。同时，要按照税务机关的要求，定期报送财务报表和纳税申报表，接受税务机关的监管和检查。对于涉及税收优惠政策的企业，要及时了解并申请相关优惠，以降低企业的税负。