1、影响正常运营。
公司出现异常不处理会直接影响到公司日常业务的处理，例如无法申请相关补贴，无法参与招投标等，大部分的大型商业活动将会受到限制，严重影响到公司的日常发展。
2、影响公司信用。
企业的日常工商、税务经营动态影响了企业的信用评级，公司异常以后，相应地将会影响评分，等级也会随之降低，进而影响企业的投资。此外，异常经营名录的公示也会损害企业的声誉。
3、增加经营成本
出现异常需要由专门的人去处理异常情况，且异常情况可能导致企业无法享受相关优惠政策。
4、法律责任风险。
一旦企业涉及违法违规行为，情况较轻的需要交相应的罚款，严重一点的就是面临吊销营业执照。