保税区转厂报关就是利用保税区，先把货物出口到保税区再从保税区报关进口。
进出口其中有一方或者双方是外资企业，使用手册报关。
加工贸易企业？？（就是三来一补企业）外商利用中国的廉价劳动力，国外进口原材料到中国进行加工生产，产品再销往国外，在原材料进口环节海关是给予保税进口的（免进口税费），这样的企业都有一个加工贸易手册。
转厂是什么意思？？转就是加工贸易企业需要通过保税区出口完成退税再进口的一个形式。货物出口到深圳坪山出口加工区视同离境，解决加工贸易企业深加工结转手续复杂。深加工增值部分不予退税问题，代替香港一日游，节省长途运输费和报关时效，出口可以是手册出口也可以是一般贸易出口，进口可以是手册保税进口也可以一般贸易征税进口。
加贸企业用贸易手册做进料加工生产，料件与成品因海关监管要求需核销、结转等情况时，将货物交入坪山保税区（不必卸货），可当天内完成货物的出口转内销(复进口)的一日游操作，入区即退税七天拿退税联！
转厂是海关术语，转厂（出口复进口）：A加贸企业将保税继电器加工的产品结转给另一加贸企业加工后复出口的经营活动。也就是说转厂只能在双方都是加贸企业才能进行。
1、一般企业销售产品给加贸企业要用“间接转厂”，就是供应商把产品出口到保税区，加贸企业再用加贸手册从保税区报关进口。这可以完全解决一般制造企业与加贸企业的转厂问题。同时，加贸企业进口是保税的，而供应商出口后可以向税务局申请出口退税。
2、同是加工贸易的两家工厂，因为隶属的主管海关不一样、手册备案的货物信息有差异，通过保税区操作，实现转厂交货的目的。双方工厂分别拿手册资料到保税区海关报关出口或进口，而且载货车辆入区不需卸货，当天即可出区通关进口，实现“转厂”操作（实际只需3个小时左右）。
3、加贸工厂供货给一般工厂，即出口转内销，也是“转厂”模式：加贸工厂将货物以手册保税核销的方式出口到保税区(深圳出口加工区)，一般工厂则以一般贸易的方式征税进口国内。
深圳出口加工区是目前广东地区功能较全面的保税物流出口加工区。处于政策的扶持，还被赋予了出口退税,深圳出口退税 （货物进区即可申请退税）的政策优势。
转厂货物入区环节：
1、中午12点前出口方将次日“下单委托书”连同装箱清单和形式一同提交至合作公司；
2、接到客户指令后，与客户核对货物信息、、时间及注意事项等相关细节；
3、下午制定派车计划，并反馈车辆信息至客户；
4、车辆准时到厂取货或者由客户派车到出口加工区；
5、客户转关：当地海关封关，司机将封关资料带回海关拆关；
6、客户清关：提前将报关/报检资料正本快递或送至企业
7、制作电子单并发送海关审核；
8、现场向海关递交报关报检资料（报关委托书、报关单、核销单、箱单、、合同）
9、车辆在海关通道拆关（若查车及时通知客户），货入保税仓库，仓管人员清点查收。
10、货物卸载后，空车行驶出区
海关总署11月12日上午10时在重庆举办“海关支持打造内陆开放综合枢纽 进一步推动西部陆海新通道建设”新闻发布会。海关总署综合业务司副司长陈宗旺、重庆海关副关长王忠文、重庆市政府口岸物流办副主任向倩出席介绍支持西部陆海新通道建设情况，并答记者问。