ISO9001认证的运作应该遵循以下原则：
1. 原则是强调以顾客为中心，因为顾客是企业存在的基础，企业必须了解顾客的需求，然后满足这些需求。
2. 文件化的原则，就是将企业的方针、目标、策划的活动以及过程、活动的效果等内容以文件的形式表达，让事实与目标一致。
3. 管理的系统方法，是将相关的活动和过程作为系统加以识别、理解和管理，以实现组织的质量目标。这种方法要求我们将相互关联的过程作为一个系统加以分析、控制。
4. 过程方法将输入转化为输出的一组彼此相关的活动称为过程。组织内的质量管理体系可用过程术语描述和加以管理。
5. 强调持续改进的原则，意味着组织整体永恒致力于提高质量管理体系的有效性和效率，意味着组织应利用诸如测量、监视、分析、改进的机会来改进质量管理体系和其他相关过程。
6. 以顾客为中心和质量为焦点间的关系是密不可分的，只有明确了顾客的需求和期望，并为之提供优质的产品和服务，才能满足顾客的需求和期望，从而形成良好的口碑和品牌效应。
遵循以上原则进行ISO9001认证的运作可以帮助组织提高其整体运营效率，并确保其质量管理体系的有效性和效率。同时，这些原则也符合了当今组织管理的发展趋势，有助于组织在竞争激烈的市场环境中取得优势。
