企业进出口经营权申请流程如下：
1、经营范围变更：确定其经营范围中包含进出口业务、进出口技术等字样。
2、海关登记备案：企业进出口货物在开展相关业务前要先向所属的海关办理备案登记手续，获得海关登记编码。
3、外汇备案：企业需要办理进出口核销、收付汇的备案、并开立外汇币账户。
4、电子口岸备案：企业需向海关电子口岸申请联合审批，提交营业执照等资料进行申请，并获得入网许可，并购买相关电子设备，如IC卡、读卡器等。
5、办理自理报检登记证：在出口前需提交营业执照等资料到出检验检疫局，通过注册备案登记后，获得自理报检登记证明。
6、税务进出口备案：到税务局办理出口退税登记备案等相关税务手续。