从国内近几年的复合肥发展情况来看，肥料集约发展程度偏低，产业布局分散。我国复合肥生产企业大多数厂家生产规模小、效益低，部分企业设备能耗和原料消耗巨大，成本较高。例如，单质氮肥、磷肥和低浓度肥料的生产比例大，复合化率较低，中低端产品比重较大、全行业总体结构性产能过剩等问题在一定时期内仍无法根治。
长期以来，我国一直非常重视化肥产业的发展，尤其是全行业自主创新基础能力的提升。目前，化肥行业已成为保障国家粮食安全的重要基础性产业，在农作物增长中贡献较大。其中，复合肥的表现更是抢眼，与其他单质肥料相比，消费年均增长率最高。
在科研方面，贡献巨大的复合肥品种研究缺乏统一的组织和有效的协调机制，其创新能力、科研产出都亟待提升，才能适应新时期农业生产发展的要求。要解决这些问题，实现环境、土壤、肥效的多赢，必须加快整个化肥业的转型升级步伐。
按照目前总体农业科技水平，我国解决粮食安全还得在相当程度上依靠集约利用耕地资源和大量化肥等农资投入。根据发展规划，化肥产业将严格控制氮肥、磷肥产能的盲目扩张，鼓励发展复混肥、专用肥、生物肥及全水溶性肥料等新技术品种，利用中低品位磷矿生产的复合肥料，适度发展硝基肥料等多元肥料。