鲜花快递与一般快递行业有一定差异，由于鲜花本身受温度，撞击，挤压等外部因素影响较大，所以鲜花快递必须具备特殊的运输条件。鲜花快递的主要服务对象是中小企业和小区居民，很多企业钟爱与在前台放置一瓶新鲜的花束，使得整个企业就像鲜花一样充满活力并且能够多姿多彩。
省内鲜花运输一般为中等货车，鲜花集中放在保鲜箱内，里面放置一定数量冰块以保证低温。此类运输与空运相似，但由于汽车颠簸，鲜花有不同程度挤压损害。
室内鲜花运输一般为保水运输，保水运输方式是将被运输的花卉一束束包装好，竖立在一个梯形的塑料方桶(业内俗称“方屉”)中，桶中蓄有特制的保鲜液，然后分层装满大型冷藏车。
跨省长途鲜花运输一般以空运为主，切取的花枝须放入阴凉处，下面铺好包装纸或塑膜，将花枝放齐，轻轻包装，运输时避免挤压。如经运输花枝萎蔫，应先放在阴凉处缓缓喷水，待其舒展后再插入水中。为提高花的鲜度，延长开放时间，切花贮存以摄氏5℃为好，不同品种能贮藏半月或数月而保证新鲜。
鲜花快递行业的出现使得这种问题不再存在，专业的运输车和专业的鲜花配送员帮助企业节省了不少的人力物力。