小规模纳税人和一般纳税人在记账报税方面存在诸多差异，这些差异与企业的经营规模、税务政策紧密相关。
申报周期不同：小规模纳税人增值税申报通常按季度进行，即每年 1 月、4 月、7 月、10 月申报上一季度的增值税 ，每年申报 4 次；企业所得税也按季度预缴，年度终了后进行汇算清缴。一般纳税人增值税按月申报，需在次月 15 日前完成申报，一年申报 12 次；企业所得税同样按季度预缴，年度汇算清缴 。
税率不同：小规模纳税人增值税征收率一般为 3%（2024 年现行税率 1%） ，部分特殊业务如销售不动产适用 5% 征收率 。一般纳税人适用多档税率，销售货物、加工修理修配劳务等适用 13% 税率，提供交通运输、建筑服务等适用 9% 税率，提供现代服务业服务适用 6% 税率 。
申报表格不同：小规模纳税人申报增值税时，填写《增值税纳税申报表（小规模纳税人适用）》，表格相对简单，内容主要涉及销售额、应纳税额等基础信息；一般纳税人申报增值税时，需填写《增值税纳税申报表（一般纳税人适用）》及多个附表，如《增值税纳税申报表附列资料（一）（本期销售情况明细）》《增值税纳税申报表附列资料（二）（本期进项税额明细）》等，用以详细核算销项税额、进项税额等 。
进项抵扣不同：小规模纳税人不涉及进项税额抵扣，应纳税额直接按销售额乘以征收率计算；一般纳税人可以凭取得的增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书等合法扣税凭证抵扣进项税额，应纳税额为销项税额减去进项税额后的差额 。比如一家一般纳税人企业当月销售货物取得销售额 100 万元，销项税额 13 万元，当月购进原材料取得增值税专用发票，进项税额 8 万元，则该企业当月应缴纳增值税为 13 - 8 = 5 万元；若为小规模纳税人，当月销售额 100 万元，征收率 1%，则应缴纳增值税 100×1% = 1 万元 。
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