袋式除尘器对燃煤电厂产生的烟尘性质相对不敏感，一般而言，煤质对袋式除尘器的运行不会产生明显的影响。但也有例外，在选择袋式除尘器时对示范工程的结果应用应慎重.
滤袋的选择设计与其收集的烟尘之间会相互作用，同样的滤料由于设计的微小差异可以对压降和电厂的排尘浓度产生明显的影响，除尘效率也就不同了。
袋式除尘器的运行过程设计对袋式除尘器的运行效果也会产生严重的影响，清灰过于频繁常会导致较高的烟尘排放浓度，并会明显缩短滤袋寿命。因此需要在清灰频率和压降之间进行优化，达到更好的除尘标准。
用于电厂的袋式除尘器通常被分为多个单元室，这样滤袋可在线关闭、维修或更换。滤袋面对高速气流时运行易损坏，这经常发生在刚刚安装好的新滤袋上，因此必须对新安装(更换)滤袋的启动进行认真仔细地控制。
清灰后滤袋的阻力来自2个方面，滤袋纤维中的颗粒和附着在袋上在清灰过程中未被清掉的灰层。清灰效果与进入袋内的含尘气体及附着在袋上灰层的厚度及性质有关，运行过程中的某些偏差可能会导致灰层强度的增加。例如低温运行可以导致灰层上的酸冷凝，锅炉管道的泄漏可导致烟尘带水造成灰层硬化，燃油时操作不当可导致烟尘带油等。