若输往美国的产品为低酸罐头或酸化食品，除进行以上食品企业注册外，企业还必须按FDA的21 CFR108要求进行FCE（Food Canning Establishment）及SID（Submission Identifier）注册。
每一个食品设施只需要注册一次。然而，如果需要的注册信息变更了，那么注册信息需要进行适时的更新。如果以往提交的注册信息发生变化，该设施必须在变化后60个日历日内更新注册信息，设施所有者变更除外。如果设施异主，前所有者需要在发生变化后60个日历日内注销注册信息，新所有者重新提交注册（21 CFR 1.234）。
谁必须做FDA注册？生产/加工、包装或储藏在美国消费的人类食品或动物饲料的国内或国外设施的所有者、经营者或负责的代理商或由他们授权的个人，必须在2003年12月12日之前向FDA注册其设施。对美国国内设施，无论该设施是否进入州际贸易均必须注册。国外设施在注册时，必须一个美国代理人（如设施的进口商或经纪人），其必须在美国居住或有经营场所，且必须身处美国。
动物食品FDA注册FDA企业注册号，2011年1月4日颁布的食品安全现代化法案（Food Safety Modernization Act，FSMA）修订了联邦食品、药品和化妆品法案（Federal Food, Drug and Cosmetic Act，FD&C法案）的相关内容，要求从事生产、加工、包装和储存的食品企业应向FDA提交额外的注册信息，包括允许FDA实施现场审查（此类检查并不通过出口国官方主管机构实施），以及每隔一年的延续注册制度（每个偶数年的10月1日到12月31日期间），并授权 FDA在某些情况下可以暂停企业的注册。
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