为了执行《生物反恐法》的规定，FDA制定了相关要求，自2003年12月12日起，所有在美国****消费的食品生产、加工、包装和储存企业必须向FDA进行注册，获得相关FDA注册号，所以FDA食品注册也称FDA反恐注册，注册系统为FDA行业系统（FDA Industry Systems，FIS系统）。
大多数农场、零售食品机构、饭店、非盈利食品企业、渔船、只受到美国农业部(USDA)监管的企业可以免予注册。豁免企业涉及情形众多，具体可豁免注册的情形，可以并参考美国FDA发布的《行业指南：关于食品企业注册的问答（第7版）》B章节自行判断是否在豁免注册范围内。
食品、饮料和膳食补充剂的FDA批准：FDA不批准食品、饮料或膳食补充剂，在美国销售产品之前，食品设施不需要获得任何类型的认证或批准，食物产品必须做FDA注册，但在FDA注册并不表示FDA批准该设施或其产品。
面食FDA注册办理流程介绍，每一个食品设施只需要注册一次。然而，如果需要的注册信息变更了，那么注册信息需要进行适时的更新。如果以往提交的注册信息发生变化，该设施必须在变化后60个日历日内更新注册信息，设施所有者变更除外。如果设施异主，前所有者需要在发生变化后60个日历日内注销注册信息，新所有者重新提交注册（21 CFR 1.234）。
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