当公司注销时发现有异常情况时，首先需要了解引起异常的原因，然后针对异常情况准备相应资料进行处理。常见的异常情况包括工商异常和税务异常。
工商异常通常是由于未按时进行工商变更或者经营范围超出执照范围等原因导致的。对于这种情况，可以通过公司注销代理机构进行工商异常解除，移出工商名录后，公司同样还是可以正常进行经营。
税务异常则可能是由于未按时进行税务申报、虚假申报、发票与申报不符、未按时缴税、偷税漏税等原因导致的。对于这种情况，需要按照相关规定进行补税、滞纳金、罚款，并缴纳后才能解除异常情况。
此外，还有其他一些异常情况，如经营地址搬迁未及时变更地址、企业经营范围超出执照范围等，需要根据具体情况进行处理。在处理异常情况时，需要准备好相应的材料，如公司注销代理机构出具的工商异常解除证明、税务异常需要的相关材料等。同时，还需要按照相关规定办理相应的手续，工商异常解除需要提供公司章程、股东会决议、法定代表人身份证明等材料。