在胶片摄影时代，即使对显微专家来说，拍摄一张色彩平衡的照片也是一件挑战工作。有的时候，你拍摄到的显微摄影图片与显微目镜中的画面差别之大，足以让人吃惊。而通过色温转换滤色片①进行色彩调节的过程，又很难让人满意。造成这个巨大差别的原因是，人类视觉系统已经适应了各种光线条件，在不同的环境下，能够很好的进行色彩还原②。而胶片没有这种适应能力。在数字成像时代，白平衡得以通过数字运算的方法而解决。在显微镜下，当不同色温③的光源照射在样品上时，ccd会呈现不同的颜色。这是因为在不同的光线下，由于ccd彩色信号输出的不平衡性，造成ccd彩色还原失真。一般情况下，我们习惯性地认为太阳光是白色的，已知直射日光的色温是5200k左右，卤素灯的色温是3300k左右。用传统相机的日光片拍摄时，卤素灯光由于色温太低，所以偏黄偏红。所以通常现场光线的色温低于相机设定的色温时，往往偏黄偏红，现场光线的色温高于相机设定时，就会偏蓝。ccd的白平衡装置就是根据色温的不同，调节感光材料（ccd）的各个色彩感应强度，使色彩平衡。由于白色的物体在不同的光照下人眼也能把它确认为白色，所以，白色就作为确认其他色彩是否平衡的标准，或者是说当白色正确地反映成白色时，其他的色彩也就正确了，平衡了。这就是白平衡的含义。
自动白平衡
作为显微摄像头的默认设置，自动白平衡通过一张结构复杂的矩形图，来决定画面中的白平衡基准点，以此来达到白平衡调校。这种自动白平衡的准确率是有一定限制。因此还需要手动白平衡、区域白平衡来防止偏色。
①色温转换滤色片：减少光谱中红、蓝、绿中的一个或两个来控制光线，你可以单独使用也可以组合使用来达到需要的色彩修正。显微镜常用的有黄色、绿色和蓝色滤色片。
②色彩还原：指彩色胶片经过拍摄和洗印加工，彩色摄影画面的色彩大体上和原景物的色彩相一致。
③色温是按绝对黑体来定义的，光源的辐射在可见区和绝对黑体的辐射完全相同时，此时黑体的温度就称此光源的色温。