对于初三的学生，如果父母仍然过度保护和限制行为，导致学生感到反感，可以尝试以下方法来分析和处理：
1 他们过度保护的原因。可能是因为他们深爱孩子，担心孩子面临困难或受到伤害。同时，也要表达学生的感受和需求，让父母了解他希望有更多的自由和自主权。
2 设定明确的界限：与父母一起设定明确的界限，让学生有足够的自由和空间去发展自己的兴趣和爱好。同时，也要确保父母对学生的学习和安全负起责任。
3 增强学生的自我保护意识：教导学生自我保护的方法和技巧，让他了解如何应对危险和挑战。这样可以让父母减少一些不必要的担忧，同时也增强了学生的自我保护能力。
4 寻求外部支持：如果过度保护和限制的问题持续存在，且对学生的心理健康和学习造成负面影响，可以考虑寻求专业心理咨询或家庭治疗师的帮助。
通过以上方法，可以帮助家庭逐渐调整对学生的保护方式，促进他的独立性和全面发展。同时，也需要注意给予学生足够的安全感和支持，以帮助他更好地应对未来的挑战。
最重要的是，要保持耐心和理解，逐步引导父母认识到学生的成长需求和独立性。同时，也要鼓励学生表达自己的想法和感受，让他有机会在家庭中发挥自己的作用和价值。