连锁经营具有多种模式，包括特许经营、直营连锁、自由连锁，三种连锁模式具有较大区别，现就特许经营与另外两种模式的区别进行简要说明。
一、特许经营与直营连锁的区别
(1）产权关系。特许经营和直营连锁的主要区别在于产权关系上，即直营连锁的店铺是由总部直接投资的，而特许经营的店铺是由受许人投资的。
(2）法律关系。直营连锁体系中，总部和分店之间是直接隶属关系，由公司内部的管理制度进行调整。而特许经营体系中，总部和分店是平等的合作关系，双方权利义务在合同中进行规定。
(3）管理方式。在直营连锁中，总部对各分店拥有所有权，对各分店具体事务均有决定权。而在特许经营中，加盟店的日常经营管理是由受许人自行负责的，加盟店的人事和财务等决策权在受许人。当然，受许人需要遵照合同约定按照特许人的统一模式规定来经营加盟店。
二、特许经营和自由连锁的区别
特许经营和自由连锁的相同点在于分店与总部不属于统一投资主体，在法律上都属于平等的民事主体关系。两者的区别主要有以下几点。
(1）品牌使用。在特许经营中，分店经授权使用总部的品牌开展经营活动；在自由连锁中，分店一般都使用自己的品牌进行经营。
(2）经营模式。在特许经营中，分店需要按照总部的统一模式来进行经营管理；而自由连锁体系中，对分店的日常经营管理没有统一化的强制性要求。
(3）总部功能。在自由连锁中，总部为各连锁店提供相关的管理、服务或协调，更多的是对成员店日常经营管理促进的服务，其强制性的管理力度比较小。而特许经营的总部除了服务支持，还具有监督、管理的功能，其管理更具强制性。
当前，在我国的连锁品牌中，如古茗、茶百道、肯德基、瑞幸咖啡、小龙坎火锅、钱大妈、百果园、正新鸡排等都属于特许经营模式，而2024年前的海底捞，以及成都地区的红旗连锁超市、奈雪的茶等则属于直营连锁模式，世纪联华、北京华联、华润万家、华润苏果等则属于自由连锁模式。
注：内容引用于《特许经营实战指南》