GB/T 11799-2008《船用防爆离心通风机》与其他船用通风机标准的区别主要体现在以下方面：
GB/T 11799-2008：仅适用于船用防爆离心通风机，用于存在爆炸性气体环境的船舶场所，如油船、化学品船等的通风换气.
其他船用通风机标准：如 GB/T 11864-2008 船用轴流通风机、GB/T 11865-2008 船用离心通风机，适用于普通船用环境下的通风换气，为船舶舱室、机舱等提供通风服务.
防爆性能：GB/T 11799-2008 对通风机的防爆结构、材质、密封等有严格要求，外壳需能承受爆炸压力，防止火花和高温传播；其他标准通风机无此特殊防爆要求，但对通风机的效率、噪声、振动等一般性能指标有规定.
材料选择：因防爆需求，GB/T 11799-2008 要求通风机部分部件采用防爆、耐腐蚀的铝合金等材料；其他标准在选材上更注重强度、重量和耐腐蚀性等常规性能，如船用轴流通风机常采用玻璃钢等轻质高强材料.
防爆试验：GB/T 11799-2008 包含专门的防爆试验，以验证通风机在爆炸性气体环境中的安全性；其他标准则主要进行性能试验，如通风机的风量、风压、功率、效率等指标的测试，以确保其通风效果和运行性能.
标志：GB/T 11799-2008 要求通风机有明确的防爆标志和相关警示标识；其他标准通风机标志主要包含产品型号、规格、生产厂家等基本信息.
包装：GB/T 11799-2008 对包装的防爆、防潮、防震等性能有严格要求，以保证通风机在运输和贮存过程中的防爆性能不受影响；其他标准的包装更注重对通风机外观和性能的保护，防止在运输过程中受到损坏.