超声治疗仪申请注册的费用通常包括以下几个方面：
一、申请费用提交医疗器械注册申请时，需要支付一定的申请费用。这个费用根据产品的分类和风险等级而有所不同。例如，在中国，不同类型的医疗器械（如一类、二类、三类）的注册费用是不同的，而超声治疗仪通常被归类为较高风险的医疗器械，因此其申请费用可能相对较高。
二、技术评审费用监管会对提交的技术文件进行详细的评审，以产品的安全性和有效性。这一过程中产生的技术评审费用通常由申请企业支付。技术评审费用可能包括专家评审费、材料审核费等。
三、产品检验费用某些类别的医疗器械在注册前需要进行产品检验，以验证其符合相关标准和要求。超声治疗仪作为医疗器械的一种，可能需要进行产品检验，因此会产生相应的检验费用。这些费用可能包括检验的检测费、样品费等。
四、临床试验费用（如适用）如果超声治疗仪需要进行临床试验以验证其安全性和有效性，那么临床试验的费用也需要由申请企业承担。临床试验费用可能包括试验设计费、试验执行费、数据收集和分析费等。需要注意的是，并非所有超声治疗仪的注册都需要进行临床试验，这取决于当地监管的法规要求和产品的特性。
五、现场审核费用（如适用）对于某些高风险类别的医疗器械，监管可能会要求进行现场审核，以检查企业的生产现场、质量管理体系等方面是否符合要求。如果超声治疗仪被归类为需要现场审核的产品，那么审核过程中产生的差旅费用、检查费用等也需要由申请企业承担。
六、年度注册费用（如适用）在获得医疗器械注册证书后，一些地区可能还要求企业每年支付年度注册费用，以维持注册证书的有效性。这个费用通常根据产品的类别和注册地区的规定来确定。
七、其他费用除了上述费用外，还可能包括一些其他费用，如注册代理费用（如果委托了注册代理进行申请）、文件翻译费用（如果需要将文件翻译成当地语言）、法律咨询费用等。
需要注意的是，具体的费用标准和金额可能因地区、产品类型、注册等因素而有所不同。因此，在申请注册前，建议申请企业与当地的监管或的医疗器械注册咨询进行联系，了解具体的费用标准和流程，并做好充分的预算和准备。