北京西城区公司股权变更缴纳企业所得税的具体流程如下：
前期准备
内部决策：召开股东会或董事会，就股权变更事宜进行讨论并形成决议，确定转让方、受让方、转让价格、转让比例等关键信息，决议需由与会股东或董事签字。
签署协议：转让方和受让方签订股权转让协议，明确转让标的、价格、支付方式、违约责任等条款，协议签订后需加盖公司公章并由双方签字。
计算税款
确定计税依据：企业所得税的计税依据为股权转让所得，即转让收入减去股权原值和合理费用后的余额。
计算应纳税额：根据确定的计税依据，按照企业所得税的税率计算应纳税额。企业所得税的基本税率为 25%，符合条件的小型微利企业等可享受相应税收优惠。
税务申报
准备申报材料：一般需提供股权转让协议、股东会决议、公司章程修正案、股权变更相关的工商变更登记资料、企业的财务报表等。
填写申报表格：按照税务部门要求，填写企业所得税纳税申报表，准确填写股权转让收入、股权原值、合理费用等信息。
提交申报：可通过线上申报系统或前往西城区当地税务机关办税服务厅提交申报材料和申报表格。
税务审核
资料审核：税务机关对企业提交的申报材料和申报表格进行审核，检查资料是否齐全、信息是否准确、股权转让行为是否符合税法规定等。
实地调查（如有需要）：对于存在疑点或申报计税依据明显偏低且无正当理由的情况，税务机关可能会进行实地调查，核实股权转让的真实性和合理性。
税款缴纳
缴纳方式：企业在收到税务机关的纳税通知后，可通过银行转账、网上申报缴税等方式缴纳企业所得税。
缴纳期限：按照税务机关规定的期限缴纳税款，避免逾期产生滞纳金等额外费用。
税务变更登记
提交申请：在完成税款缴纳后，企业应及时向税务机关申请办理税务登记变更，提交税务登记变更申请书、股权转让协议、新营业执照副本复印件等材料。
信息更新：税务机关审核通过后，将对企业的税务登记信息进行更新，将股权变更后的相关信息录入税务系统，确保税务登记信息的准确性和及时性。