集装箱码头的装卸工艺有几种典型的系统，底盘车系统、跨运车系统、龙门吊系统及混合型系统。
一、底盘车系统(trailer chassis system)。
码头的前沿采用岸边集装箱装卸桥承担船舶的装卸作业，进口集装箱由装卸桥直接卸到底盘车上，集装箱牵引车将载有集装箱的底盘车拖到堆场停放，出场时集装箱牵引车将载有集装箱的底盘车从堆场上直接拖出港区。出口集装箱由集装箱牵引车将载有集装箱的底盘车从港区停放在堆场上，装船时再由集装箱牵引车将载有集装箱的底盘车从堆场拖到码头前沿，由岸边集装箱装卸桥将箱吊装上船。该系统的主要特点是，集装箱在码头堆场的整个停留期间均放置在底盘车上。
1. 底盘车系统的主要优点。
(1)集装箱在港的操作次数减少，装卸效率高，损坏率小;
(2)工作组织简单，对装卸工人和管理人员的技术要求不高。
2. 底盘车系统的主要缺点。
(1)底盘车的需求量大，投资大，在运量高峰期可能会出现因底盘车不足而间断作业的现象;
(2)不易实现自动化。
3. 底盘车系统主要适用集装箱码头的起步阶段，特别是整箱货比例较大的码头。
二、跨运车系统。
码头前沿采用岸边集装箱装卸桥承担船舶的装卸作业，跨运车承担码头前沿与堆场之间的水平运输，以及堆场的堆码和进出场车辆的装卸作业。即“船到场”作业是由装卸桥将集装箱从船上卸到码头前沿，再由跨运车将集装箱搬运至码头堆场的指定箱位;“场到场”、“场到集装箱拖运车”、 “场到货运站”等作业均由跨运车承担。
1. 跨运车系统的主要优点。
(1)跨运车一机完成多种作业(包括自取、搬运、堆垛、装卸车辆等)，减少码头的机种和数量，便于组织管理;
(2)跨运车机动灵活、对位快，岸边装卸桥只需将集装箱卸在码头前沿，无需准确对位，跨运车自行抓取运走， 充分发挥岸边集装箱装卸桥的效率;
(3)机动性强，既能搬运又能堆码，减少作业环节;
(4)堆场的利用率较高，所需的场地面积较小。
2. 跨运车系统的主要缺点。
(1)跨运车机械结构复杂，液压部件多，故障率高，对维修人员的技术要求高，且造价昂贵;
(2)跨运车的车体较大，司机室位置高、视野差，操作时需配备助手;
(3)司机的操作水平要求较高，若司机对位不准，容易造成集装箱损坏。
3. 跨运车系统适用的码头。
该系统适用于进口重箱量大、出口重箱量小的集装箱码头。
三、轮胎式龙门起重机系统。
轮胎式龙门起重机系统的码头前沿采用岸边集装箱装卸桥承担船舶的装卸作业，轮胎式龙门起重机承担码头堆场的装卸和堆码作业，从码头前沿至堆场、堆场内箱区间的水平运输由集卡完成。轮胎式龙门起重机一般可跨6列和1列集卡车道，堆高为3至5层集装箱。轮胎式龙门起重机设有转向装置，能从一个箱区移至另一个箱区进行作业。轮胎式龙门起重机系统适用于陆地面积较小的码头。我国大部分集装箱码头采用这种工艺系统。
四、轨道式龙门起重机系统。
轨道式龙门起重机系统与轮胎式龙门起重机系统相比，堆场机械的跨距更大，堆高能力更强。轨道式龙门起重机可堆积4～5层集装箱??可跨14列甚至更多列集装箱。轨道式龙门起重机系统适用于场地面积有限，集装箱吞吐量较大的水陆联运码头。
五、跨运车-龙门吊混合系统。
从经济性和装卸性能的观点来看，前四项工艺系统方案各有利弊，目前世界上有些港口采用了前述工艺方案的混合系统，跨运车一龙门吊混合系统，其主要特点是：
(1)船边的装卸由岸边集装箱装卸桥承担;
(2)进口集装箱的水平运输、堆码和交货装车由跨运车负责完成;
(3)出口箱的货场与码头前沿之间的水平运输由集装箱半挂车完成，货场的装卸和堆码由轨道式龙门起重机完成。由于混合系统能充分发挥各种机械的特点，扬长避短，更加趋于合理和完善，目前世界上已有不少码头采用了这种方案。