可以把商业发票金额做低去办理贸促会认证，但这种做法存在风险，并且需要满足一定条件。以下是对此问题的详细分析：
一、可以做低金额办理贸促会认证的情况在某些情况下，企业可能因各种原因导致商业发票金额与报关单金额不符，但仍可以办理贸促会认证。这些原因包括但不限于：
价格术语使用不同：例如，报关时采用CIF价（成本加保险费加运费），而商业发票则采用FOB价（船上交货价），导致商业发票金额比实际报关金额少。
计价单位不同：如出口面料时，报关以千克为计价单位，而商业发票则以米为计价单位，货物实际数量经过折算后与报关数量有误差，导致发票金额与报关金额不符。
漏装、错装或提供免费配件：因港口装运人员疏忽或舱位紧张，个别货物漏装或未能装船，使得货物实际装船数量少于报关数量，或者企业在出口整机的同时附赠客户少量配件，这些配件虽和整机一同报关但商业发票中不体现价值，导致商业发票金额低于报关金额。
对于上述原因引起的金额差异，如果差异在合理范围内，贸促会可能会接受商业发票认证的申请。但要求企业在商业发票上显示出相关细节，如注明价格术语、运费、保险费，注明免费配件的数量、金额等，并出具保函说明商业发票金额与报关单不符的原因，声明承担一切不良后果。
二、做低金额办理贸促会认证的风险尽管在某些情况下可以做低金额办理贸促会认证，但这种做法仍然存在风险：
税务风险：如果销售商低开发票，可能面临税务部门的调查和处罚。根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，虚开发票的税务机关将没收违法所得，并根据虚开金额的大小处以不同额度的罚款。
公司信誉受损：低开发票还可能导致销售商的信誉度下降，甚至可能被吊销营业执照，严重影响公司的经营状况和发展前景。
清关问题：虽然多个国家并未实现报关数据互通，但仍有被查处的风险。一旦被发现低开发票，可能会导致货物被强制退回装运港并处以罚款。