有害生物的含义受到其产生与发展过程的影响，不能简单地从字面上理解。一方面，许多对人类有害的生物，早已自立门户，成为单一学科。例如，对人致病的微生物，有毒植物，以及蝗虫等农业害虫，目前习惯上尚未包含在有害生物范畴之内，另一方面，随着形势的发展，有害生物的涵盖面仍在调整，主要倾向是扩大。例如，白蚁、红火蚁、鼹鼠等正在列入有害生物的行列。
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有害生物控制的前提是要知道有害生物的种类。有害生物的种类繁多，有害生物防制员要知道控制的有害生物属于哪一种，主要识别的依据是什么。要准确鉴定物种必须有很好的生物分类学的基础知识，特别是昆虫分类学的基础。对于有害生物防制员来讲，不要求系统地掌握生物分类学的基础理论，主要是根据一些外部形态特征、发生的环境等来判别是属于哪一类有害生物或是哪一种生物即可。
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