收购高新企业需要考虑以下税务问题：
企业所得税方面：
税率差异：高新企业通常享受 15% 的企业所得税优惠税率。收购后，需关注企业是否仍满足高新企业的认定条件，如研发投入比例、高新技术产品收入占比等。如果不再符合条件，企业所得税税率可能恢复到 25%，这会对企业的税负产生较大影响。
税务处理方式：如果符合特殊性税务处理的条件，可暂不确认资产转让所得或损失，递延纳税。例如，股权收购中收购企业购买的股权不低于被收购企业全部股权的 50%，且股权支付金额不低于交易支付总额的 85% 等，同时要具有合理的商业目的等。
未弥补亏损的利用：查看被收购高新企业是否存在以前年度的未弥补亏损。收购后，收购方可以用未来的盈利弥补这些亏损，从而减少企业所得税的缴纳。但要注意亏损弥补的期限，一般不得超过 5 年。
增值税方面：
资产转让的增值税：如果收购涉及到固定资产、无形资产等资产的转让，需要考虑增值税的缴纳。例如，转让无形资产中的专利技术、非专利技术等，可能适用不同的增值税税率或免征政策。对于符合条件的技术转让、技术开发业务，免征增值税。
进项税额的抵扣：收购后，企业要关注原高新企业的进项税额是否合规，能否继续用于抵扣。如果存在进项税额发票不规范、过期等问题，可能会影响企业的增值税抵扣。
个人所得税方面：
股权转让的个税：如果收购涉及到自然人股东转让股权，转让方需要缴纳个人所得税。按照规定，股权转让所得应按 “财产转让所得” 项目，以 20% 的税率计征个人所得税。税务机关可能会对股权转让价格的合理性进行审查，如果价格明显偏低且无正当理由，可能会进行纳税调整。
股权激励的个税：若被收购高新企业存在股权激励计划，收购方需要了解员工在股权激励下的个人所得税缴纳情况。员工在行权时，企业可能需要代扣代缴个人所得税。
印花税方面：
股权转让合同印花税：收购过程中签订的股权转让合同，双方需要按照合同金额的一定比例缴纳印花税。
其他合同印花税：如果涉及到其他合同，如资产转让合同、借款合同等，也需要根据合同类型和金额缴纳相应的印花税。
其他税务问题：
税务登记变更：收购完成后，要及时办理税务登记的变更手续，包括企业名称、法定代表人、股东信息等的变更，确保税务信息的准确性和及时性。
税收优惠的延续和变更：了解被收购高新企业原有的税收优惠政策，如研发费用加计扣除、软件企业税收优惠等，在收购后是否能够继续享受。如果政策适用条件发生变化，要及时进行调整和申报。
关联交易的税务风险：如果收购后企业与被收购企业存在关联交易，要注意关联交易的定价是否符合独立交易原则。否则，可能会被税务机关进行转让定价调整，补征企业所得税。