高速大容量冷冻离心机因转子的材料组织疏密不均匀造成转子质心与几何形心不一致，转子运转时因质量不对称造成惯性主轴偏离旋转轴，都会产生不平衡，产生附加力和力矩。高速运转的转子相对离心力很大，很小的不平衡质量会产生很大的离心惯性力，这样会使离心机产生振动，增加动负荷，降低离心机的使用效果，缩短使用寿命，严重时会导致离心机损坏。
克服动不平衡的方法：
（1）高速离心时，对于沉淀量大的样品要先低速除去大颗粒。
（2）不要用密度不同的样品组成一对对应管。
（3）一对对应管中的样品重量要相同、体积要相同。
（4）离心管帽要先平衡，不同材质、不同机型的管帽重量不同，不要混用。