温室栽培条件下，因肥害引起的落花落果主要有：一是施用未腐熟的鸡粪、圈粪或过量使用碳酸氢铵等，无籽西瓜一般采用双蔓或三蔓整枝。双蔓整枝是选留主蔓外，并在主蔓基部选择一条健壮的侧蔓，其余侧蔓全部摘除。这样茎蔓分布合理，叶片通风透光，增强光合作用和抗病能力，从而增加产量提高品质。都会释放出大量的氨气，当氨气在棚室内积累到一定程度，则会造成植株中毒，引起落花落果。
从11月下旬开始，每天早晨在棚膜上覆盖草帘，关闭通风口，避免白天阳光照射使棚室的增温。到傍晚，气温下降则需揭开草帘，打开通风口进行蓄冷，使棚室内温度均低于7.2℃。该操作需持续进行15~25天，一般每亩追尿素8公斤，硫酸钾5公斤。第二次是在果实膨大期之前追施速效化肥，追肥应以钾、氮肥为主，有利于果实产量的形成和品质的改善。一般每亩追尿素20-25公斤，硫酸钾10--15公斤。水肥管理应该根据当地的土壤气候条件、瓜秧长势合理控制，做到追控结合，灌排结合。具体时间需根据不同品种而定。在休眠过程中，如果某几天夜间温度高于10℃，则需将休眠时间适当延长，确保休眠时间充分，切不可急于结束低温处理。有条件的，也可通过在棚室内放置冰块等方法达到降温目的。
叶面喷肥浓度过高，造成肥害。所以施肥要以充分腐熟的优质有机肥为主，减少化肥的施用量，压蔓一般有明压和暗压两种方式。明压是指用土块或树枝等把瓜蔓固定在地面上；暗压是用铲将土壤铲松、拍平，瓜蔓埋压在地下。一般主蔓40-50cm时压第一次，以后每隔4--6节压一次，需压2--3次。尽量少施或不施碳酸氢铵。施肥时，要开沟施入并立即覆土，以免氨气挥发引起中毒。另外，化肥的施用要少量多次、分散施入。